Chlor als Chlorid-Ion findet sich in großer Menge in der Blutflüssigkeit. Es zählt zu den absolut lebensnotwendigen Mineralbausteinen für den Menschen. Chlorid ist vornehmlich an der Regulierung des Wasserhaushaltes beteiligt. Sein Vorhandensein ist meist extrazellulär. Die Stabilisierung des osmotischen Druckes der Zellen geschieht durch das Chlorid im Zusammenspiel mit dem Natrium (ebenfalls extrazellulär, also außerhalb der Zellwände) und dem Kalium (intrazellulär) . Für diese sehr wichtige Aufgabe benötigt der Mensch, je nach Tätigkeit, 6 bis 8 Gramm täglich. Menschen die viel Wasser verlieren, also Schwerstarbeiter und Sportler, haben einen wesentlich höheren Bedarf an Mineralien als relativ unbewegliche Menschen.

Eine weitere sehr wichtige Aufgabe hat das Chlorid bei der Verdauung übernommen. An der Bildung der Magensäure (Salzsäure [HCl] )ist es wesentlich beteiligt. In den Schleimhäuten des Darmes sorgt es als feste Verbindung mit dem Natrium (Kochsalz [NaCl] ) in Zusammenarbeit mit den Sulfaten (Glaubersalz [Na₂SO₄]) für dessen Eigenbewegung und somit für eine ordnungsgemäße Verdauung.

Ein Mangel an Chlorid kann weitreichende Folgen nach sich ziehen. Infolge von Erbrechen wird der Säure-Basen-Haushalt gestört und viele Stoffwechselvorgänge werden nicht mehr korrekt ausgeführt. Überhöhte Mengen kommen im menschlichen Organismus so gut wie nicht vor, da ein Überangebot im Normalfalle überhaupt nicht aufgenommen, sondern überwiegend über die Haut direkt ausgeschieden wird.